Niektóre strony internetowe wymagają szczególnej analizy. W wyjątkowych przypadkach może okazać się, że witryna nie poddaje się łatwo detekcji kontrolek przez Web Hunter. Wtedy należy poszukać alternatywnych rozwiązań, np. obsłużyć stronę poprzez wysłanie klawiszy lub skorzystać z huntera graficznego.
Może się okazać, że kontrolki na pierwszy rzut nie są widoczne w hunterze, ale są ukryte w wewnętrznych warstwach strony, dlatego rekomenduje się sprawdzanie, czy po kliknięciu w okrągłą strzałkę nie pojawią się kolejne warstwy, z których kontrolki uda się pobrać.